Infinium Asian Screening Array-24 Kit

一种功能强大、经济高效的基因分型芯片,适用于在东亚人群中开展的大规模遗传研究和药物基因组学研究。

约2304个样本/周(估计假设1个iScan系统、1个AutoLoader、2个Tecan机器人,每周工作5天) 

样本通量

每张芯片24个样本

样本数量

固定标记物:约660,000,定制标记物扩展容量可达50,000

标志物数量

详情请参见规格表

概述

Infinium Asian Screening Array Kit包含用于24个样本的BeadChip和试剂,用于东亚和东南亚人群的群体遗传研究。

  • 使用包含>9K全基因组序列的东亚参考panel,覆盖千人基因组计划中代表不足的人群

  • 包括更新的临床研究和疾病相关内容

  • 保持高数据质量,检出率>99%,可重现性>99.9%

专家精选的内容

该芯片与领先机构合作设计。内容包括使用临床研究变异的全基因组骨架、QC标志物、发现panel和定制附加内容。

广泛采用

该芯片建立在Infinium Global Screening Array商业成功的基础上。全球用户社区已经订购了超过2000万个Illumina Infinium Array。 

稳定且可扩展

支持多种样本类型(例如,唾液、血液、口腔拭子和FFPE样本)的基因分型和CNV检出。高通量工作流程以更少的成本、仪器、实验室空间和手动操作时间提供强大的样本处理能力。

预先设计的booster内容作为可选的附加内容提供。

规格

需要的产品

将您选择的试剂盒大小与每次运行的样本数量相匹配。每个试剂盒均按单批次处理,不可用于多个实验。如果要处理多个低通量批次,请订购多个小型试剂盒。

您可以选择使用DesignStudio自定义您的内容,也可以从联盟助推器提供的附加内容列表中选择。多种疾病标志物(约5万个SNP)提供了增强子附加内容。

请咨询您的销售代表,确认供货情况和定价。

Infinium FFPE QC Kit和Infinium HD FFPE DNA Restore Kit是可选的,但建议将Infinium Asian Screening Array与福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本一起使用。

/ 结果

应用

Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChip支持经济高效、可扩展的东亚人群基因组筛查,适用于广泛的临床研究和变异筛查应用,包括疾病关联和风险分析研究、药物基因组学研究、疾病表征、生活方式和健康表征以及复杂疾病的标志物发现。

工作流程示例

3
追踪、分析和报告

相关应用和方法

其他人如何使用该产品

比较

Infinium Asian Screening Array-24 Kit Infinium Global Screening Array-24 Kit Infinium Global Diversity Array-8 Kit
实验分析方法类型 Infinium HTS Infinium HTS Infinium LCG
自动化功能 自动化芯片装载器, 液体处理机器人 自动化芯片装载器, 液体处理机器人 自动化芯片装载器, 液体处理机器人
说明 先进的基因分型芯片,为东亚和东南亚人群的群体规模遗传研究、变异筛查和精准医疗研究提供了高价值、可扩展且经济高效的解决方案。  Infinium Global Screening Array-24 Kit是用于群体规模遗传学、转化研究、变异筛查研究和精准医学研究的经济型基因分型芯片,结合了优化的多种族全基因组内容、精选的临床研究变异和QC标记。 8样本的Infinium Diversity Array为整个基因组的4800多个关键基因提供了目标区域覆盖度。BeadChip中包含约180万个标记物,可高度覆盖疾病相关区域的外显子,提供高度准确的拷贝数变异检出,平均分辨率为1.5 Mb。
起始量 200 ng gDNA 200 ng 200 ng
系统 iScan iScan iScan
方法 高通量基因分型芯片, 全基因组基因分型芯片 高通量基因分型芯片, 全基因组基因分型芯片 全基因组基因分型芯片
核酸类型 DNA DNA DNA
标志物数量 固定标记物:约660,000,定制标记物扩展容量可达50,000 654,027个固定标记。自定义标记附加功能: 高达100K  1,825,277个固定标记。定制标记物扩展容量:高达175K
样本数量 每张芯片24个样本 每张芯片24个样本 每个芯片8个样本
样本通量 约2304个样本/周(估计假设1个iScan系统、1个AutoLoader、2个Tecan机器人,每周工作5天)  每周约5760个样本 每周约1728个样本
特殊的样本类型 血液, FFPE组织 血液, FFPE组织, 口腔拭子, 唾液 血液, FFPE组织, 口腔拭子, 唾液
物种 人 人 人
技术 Illumina芯片 Illumina芯片 Illumina芯片
变异类别 单核苷酸多态性(SNP), 结构变异, 插入缺失(indel), 拷贝数变异(CNV) 单核苷酸多态性(SNP), 结构变异, 拷贝数变异(CNV) 单核苷酸多态性(SNP), 杂合性缺失(LOH), 染色体异常, 结构变异, 拷贝数变异(CNV)

选择工具

图

Infinium Asian Screening Array上的临床研究内容

临床研究内容是由专家从科学界公认的数据库中挑选的,用于为临床研究应用创建一款信息量大的芯片。变异数量为2018年8月的最新数据,可能会变化。

广泛的药物基因组学标志物

临床研究内容包含根据CPIC1指南和PharmGKB2数据库选择的大量药物基因组学标记。这些标记是根据PharmGKB数据库定义的可信度水平来安排的。VIP,非常重要的药物基因。

用于构建Infinium Asian Screening Array的全基因组序列

用于构建Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 BeadChip的全基因组测序数据包括韩国、蒙古和马来西亚样本,目前尚未在公开的参考群体中展示。

侧重于群体 缩写: 队列 测序深度
中国人 CHS-GIS 新加坡基因组研究院 30×
中国南方汉族人 CHS 1000G——中国南方汉族人 2–4×
中国傣族人 CDX 1000G——中国西双版纳傣族人 2–4×
中国汉族人 CBD 1000G——北京 2–4×
日本人 R-JAP1 RIKEN W13 15×
日本人 R-JAP2 RIKEN W1–6 30×
日本人 R-JAP3 RIKEN W18 >30×
日本人 K-JAP 京都 3–15×
日本人 JAP 1000G——东京 2–4×
韩国人 M-KOR MACROGEN 15–30×
韩国人 KPGP 韩国个人基因组计划(KPGP) 约35倍
马来西亚人 MAL 新加坡群体健康研究 30×
蒙古人 MON MACROGEN 30×
越南语 KVT 1000G——胡志明市京族人 >2–4×
  1. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC). cpicpgx.org。2016年10月访问。

  2. PharmGKB,药物基因组学知识库。www.pharmgkb.org。2017年1月访问。

固定内容 (3)

Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 Kit (48样本)

20016317

Asian Screening Array是一种通用的全基因组芯片,用于经济的遗传风险筛查。每个试剂盒内有2个BeadChip芯片和可用于48个DNA样本的扩增、片段化、杂交、标记和检测试剂。

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Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 Kit (288样本)

20016318

Asian Screening Array是一种通用的全基因组芯片,用于经济的遗传风险筛查。每个试剂盒包含12个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测288个DNA样本的试剂。

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Infinium Asian Screening Array-24 v1.0 Kit (1152样本)

20016319

Asian Screening Array是一种通用的全基因组芯片,用于经济的遗传风险筛查。每个试剂盒包含48个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测1152个DNA样本的试剂。

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附加内容 (3)

Infinium Asian Screening Array-24+ v1.0 Kit (48样本)

20016320

Asian Screening Array是一种通用的全基因组芯片,用于经济的遗传风险筛查。每个试剂盒内有2个BeadChip芯片和可用于48个DNA样本的扩增、片段化、杂交、标记和检测试剂。

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Infinium Asian Screening Array-24+ v1.0 Kit (288样本)

20016321

Asian Screening Array是一种通用的全基因组芯片,用于经济的遗传风险筛查。每个试剂盒包含12个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测288个DNA样本的试剂。

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Infinium Asian Screening Array-24+ v1.0 Kit (1152样本)

20016322

Asian Screening Array是一种通用的全基因组芯片,用于经济的遗传风险筛查。每个试剂盒包含48个BeadChip芯片,以及用于扩增、片段化、杂交、标记和检测1152个DNA样本的试剂。

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配套产品 (2)

Infinium FFPE QC Kit (384次反应)

WG-321-1001

Infinium FFPE QC Kit是使用Nextera Flex for Enrichment鉴定FFPE样本所需的配套产品。文库制备、富集、富集探针panel以及标签接头试剂需单独订购。

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Infinium HD FFPE DNA Restore Kit (24样本)

WG-321-1002

该试剂盒内含一组用于修复受损FFPE DNA的新型试剂。修复后的DNA可通过支持FFPE的Illumina Infinium BeadChip芯片进行基因分型,以获得高质量的数据。Infinium FFPE Restore Kit内的试剂可供修复24个FFPE DNA样本。

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常见问题解答

是的,FFPE样本可以在Infinium Asian Screening Array -24 v1.0 BeadChip上使用Infinium FFPE QC Kit和Infinium FFPE Restore Kit运行。

在iScan系统上扫描每个样本需要2.5分钟。

Infinium Asian Screening Array BeadChip Kit包含BeadChip和试剂,可使用高通量、简化的Infinium工作流程扩增、片段化、杂交、标记和检测遗传变异。

Infinium Asian Screening Array包括亚洲发现panel,其中标签SNP选择的变异>45K,用于填补靶向芯片的覆盖度和推定的功能丧失。如需了解更多信息,请参阅数据表。
/ 结果

NovaSeq X系列

将先进的化学、光学和信息学技术相结合,实现了超凡的速度和数据质量、出色的通量和可扩展性。

MiSeq v2试剂盒

与v1试剂盒相比,v2试剂盒可为MiSeq基因测序仪增加簇密度和读长,从而提高测序质量分值。

TruSight Oncology 500

使用涵盖所有主要变异类别以及来自FFPE组织的基因特征(TMB、MSI和HRD)的大型泛癌panel实现CGP。

Illumina DNA Prep

快速、集成的文库制备工作流程,适用于各种测序应用。

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